上海捷瑞生物工程有限公司
引物合成
主要技術原理
用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,則未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,而發生甲基化的胞嘧啶不變。根據某一待測位點或者調查的某一區域序列設計引物進行PCR擴增,通過PCR電泳、測序、熒光定量及質譜等方法對擴增產物進行檢測,根據檢測結果分析基因組甲基化的情況。
服務特點
精確度高,能明確目的片段中每一個CpG位點的甲基化狀態
主要服務方案
1. 亞硫酸氫鹽測序法(Bisulfite Sequencing PCR,BSP)
實驗原理:
用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變。針對要調查的區域設計BSP引物進行PCR擴增,對擴增產物進行測序就可以判斷哪些CpG位點發生了甲基化。根據測序方式不同,又分為以下幾種:
a. BSP直接測序法:對于BSP引物擴增產物直接進行測序;
b. BSP克隆測序法:將PCR產物克隆,之后提取質粒進行測序,此方法成功率高、檢測方便,適合常規數量樣本的特定靶標區域甲基化分析,是國際通用的甲基化分析金標準;
c. BSP高通量測序法:可以進行目標片段甲基化水平分析,也可進行全基因組甲基化水平分析。
技術特點:準確度高、能給甲基化位點精確定位、可重復性高
實驗流程:
(1)BSP引物設計:針對感興趣的基因區域進行BSP引物的設計(一般擴增產物不超過300bp)
(2)亞硫酸氫鹽處理基因組DNA:提取基因組DNA并進行亞硫酸氫鹽的轉化
(3)PCR擴增目的片段:BSP引物擴增感興趣的區域
(4)克隆到載體:將PCR產物純化后連接到T載體上
(5)克隆測序:挑取陽性*斑,提取質粒并測序
(6)序列分析:對測序的結果進行比對和甲基化分析(一般10個克隆子)
2. 熒光定量法(Methylight)
此方法利用TaqMan 探針和PCR引物來區分甲基化和未甲基化的DNA。首先用亞硫酸氫鹽處理DNA片段,針對甲基化和未甲基化序列各設計一個探針,用不同的熒光標記,隨后開展實時定量PCR。如果探針與DNA雜交則釋放出熒光信號,根據熒光信號的強度比值計算甲基化水平。
技術特點
檢測通量高。早期由于沒有其它高通量的檢測方式,用熒光定量法針對較多的樣品進行檢測時,是一個比較好的檢測方案。但是該方法問題比較多,待檢測的區域只有一個甲基化位點時,探針的區分度不高。同時,為了達到比較好的區分效果,一般采用MGB探針,探針成本較高。如果只是檢測少量樣品,探針分攤成本很高?,F在針對較多的樣品待檢測時,通常都會采用高通量測序法,快速、準確,成本可控。
客戶提供
1 要調查的基因名稱、種屬
2 要調查的甲基化區域或位點
3 足量的科研樣本,保證樣本質量,提供清晰樣品編號
送樣要求
1 樣品要求:細胞≥105個;基因組DNA ≥5ug
2 所有樣品建議干冰或冰袋運輸,保證樣品質量
檢測周期
常規檢測任務2-4周內完成,具體時間根據樣本量和檢測的基因數而定。
下單流程
直接訂購:將需求內容給直接發送到support@generay.com.cn,或致電021-67840418
網上訂購:捷瑞網站首頁→訂單下載→下載甲基化服務訂單→填寫完整實驗信息→發送至support@generay.com.cn
報告內容
提供完整實驗報告、電泳圖、測序結果、序列比對結果、甲基化點狀圖、柱狀圖以及初步分析數據等。
注:可登陸捷瑞公司首頁下載甲基化檢測報告示例,流程如下:
登陸捷瑞公司首頁------技術支持----技術資料---下載甲基化檢測報告示例。